斑點(diǎn)雜交
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是指將待測(cè)的DNA變性后點(diǎn)加在硝酸纖維素膜(或尼龍膜,NC膜)上,用已標(biāo)記的探針進(jìn)行雜交,洗膜(除去未接合的探針),放射自顯影,判斷是否有雜交及其雜交強(qiáng)度,主要用于基因缺失或拷貝數(shù)改變的檢測(cè)。
斑點(diǎn)雜交(Dot blot)是將被檢標(biāo)本點(diǎn)到膜上,烘烤固定。這種方法耗時(shí)短,可做半定量分析。一張膜上可同時(shí)檢測(cè)多個(gè)樣品,為使點(diǎn)樣準(zhǔn)確方便,市售有多種多管吸印儀(Manifold),如MinifoldⅠ和Ⅱ、Bio-Dot(Bio-Rad)和Hybri-Dot,它們有許多孔,樣品加到孔中,在負(fù)壓下就會(huì)流到膜上呈斑點(diǎn)狀或狹縫狀。反復(fù)沖洗進(jìn)樣孔,取出膜烤干或紫外線照射以固定標(biāo)本,這時(shí)的膜就可以進(jìn)行雜交。
(1)DNA斑點(diǎn)雜交:
①先將膜在水中浸濕,再放到15×SSC中。
②將DNA樣品溶于水或TE,煮沸5min,冰中速冷。
③用鉛筆在濾膜上標(biāo)好位置,將DNA點(diǎn)樣于膜上,每個(gè)樣品一般點(diǎn)μl(2~10μg DNA)。
④將膜烘干,密封保存?zhèn)溆谩?/p>
(2)RNA斑點(diǎn)雜交:與上法類似,每個(gè)樣品至多加10μg總RNA(經(jīng)酚/氯仿或異硫氰酸胍提取純化),方法是將RNA溶于5μl
DEPC水,加5μl甲醛/SSC緩沖液(10×SSC中含6.15mol/L甲醛),使RNA變性,然后取5-8μl點(diǎn)樣于處理好的濾膜上,烘干。
(3)完整細(xì)胞斑點(diǎn)雜交:應(yīng)用類似檢測(cè)細(xì)菌菌落的方法,可以對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)物的特異序列進(jìn)行快速檢測(cè),將整個(gè)細(xì)胞點(diǎn)到膜上,經(jīng)NaOH處理,使DNA暴露、變性和固定,再按常規(guī)方法進(jìn)行雜交與檢測(cè)。有人曾用此法從105個(gè)培養(yǎng)細(xì)胞中檢測(cè)到至少5pg的Epstein-Barr病毒DNA。完整細(xì)胞斑點(diǎn)印跡法可以用于篩選大量標(biāo)本,因?yàn)樗辜?xì)胞直接在膜上溶解,所以DNA含量甚至比常用的提取法還高,又不影響與32P標(biāo)記的探針雜交,但它不適用于非放射性標(biāo)記探針,因?yàn)镈NA純度不夠,會(huì)產(chǎn)生高本底。
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