古蟲(chóng)界

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古蟲(chóng)界
籃氏賈第鞭毛蟲(chóng)，一種人體寄生蟲(chóng)
科學(xué)分類
域： 真核生物域 Eukaryota 界： 古蟲(chóng)界 (Cavalier-Smith) Simpson, 2003
門
眼蟲(chóng)門 Euglenozoa 透色門 Percolozoa 槽蟲(chóng)門 Loukozoa 后滴門 Metamonada Malawimonas

古蟲(chóng)界（excavate或Excavata）是單細(xì)胞真核生物的一個(gè)大的界^[1][2]。古蟲(chóng)界包含了許多自由生存或共生的原生生物，以及一些重要的人體寄生蟲(chóng)。命名為“古蟲(chóng)”，是因?yàn)樵谡婧松锏?a href="/w/%E7%B3%BB%E7%BB%9F%E5%8F%91%E7%94%9F%E6%A0%91" title="系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)">系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)處于底部位置，與細(xì)菌、古菌等外群關(guān)系較近，線粒體可能缺失或功能原始。

目錄 1 特性 2 分類 2.1 Discoba或JEH亞界 2.2 后滴門 2.3 單系起源 2.4 馬拉維單胞蟲(chóng) 3 參見(jiàn) 4 參考文獻(xiàn) 5 外部鏈接 6 參考來(lái)源

特性

許多古蟲(chóng)界的物種缺乏典型的線粒體，被稱作“無(wú)線粒體原生生物”（amitochondriate），雖然大多數(shù)可能包含了功能上類似于線粒體、形態(tài)有很大變化的細(xì)胞器。其它的古蟲(chóng)界的生物有線粒體，線粒體嵴呈管狀、盤(pán)狀、薄片狀。大多數(shù)古蟲(chóng)界物種有兩個(gè)、四個(gè)甚至更多的鞭毛^[3]，很多物種有顯著的腹部攝食溝（feeding groove）超微結(jié)構(gòu)，內(nèi)部由微管支撐。^[4]如果有系統(tǒng)發(fā)生的基因證據(jù)，其它缺乏這一特征的物種也可以歸屬于古蟲(chóng)界。

分類

古蟲(chóng)界在門/綱的級(jí)別上分為六類。

總門	門/綱	有代表性的屬	描述
盤(pán)嵴亞界 Discoba或JEH	眼蟲(chóng)門 Euglenozoa	眼蟲(chóng)（Euglena）、錐蟲(chóng)（Trypanosoma）	很多是重要的寄生蟲(chóng)，很多含有色素體（葉綠體）
	透色門 Percolozoa或滲養(yǎng)門 Heterolobosea	耐格里原蟲(chóng)（Naegleria）、集胞黏菌（Acrasis）	大多數(shù)的形態(tài)在鞭毛蟲(chóng)與似變形蟲(chóng)之間
	雅各巴蟲(chóng)綱 Jakobea	雅各巴蟲(chóng)（Jakoba）、異養(yǎng)鞭毛蟲(chóng)（Reclinomonas）	自由生活，有的具鞭毛，有基因豐富的線粒體
后滴門 Metamonada或POD	綱 Preaxostyla	銳滴蟲(chóng) (Oxymonads)、三鞭毛蟲(chóng)（Trimastix）	無(wú)線粒體，有鞭毛，或者自由生活（三鞭毛蟲(chóng)）或者寄生于昆蟲(chóng)的后腸（hindgut）
	多鞭毛蟲(chóng)綱 Trichozoa或Fornicata	賈第蟲(chóng)（Giardia）、Carpediemonas	無(wú)線粒體，大多數(shù)共生或寄生在動(dòng)物體內(nèi)。
	副基體綱 Parabasalia	毛滴蟲(chóng)屬（Trichomonas）	無(wú)線粒體有鞭毛，一般共生在昆蟲(chóng)腸內(nèi)。某些是人體寄生蟲(chóng)。

Discoba或JEH亞界

眼蟲(chóng)門（Euglenozoa）與透色門（Percolozoa, Heterolobosea）是特別接近的親緣關(guān)系，都具有盤(pán)狀的線粒體嵴，因此被歸納為盤(pán)嵴總門（Discicristata）。2007年，一項(xiàng)研究表明盤(pán)嵴總門與Jakobida目具有基因親緣關(guān)系^[5] Jakobida目具有類似于其它原生生物的管狀線粒體嵴，因此與盤(pán)嵴總門合稱為Discoba亞界或三者首字母縮寫(xiě)——JEH總界。^[2]

后滴門

后滴門（Metamonad）不尋常地缺少了典型的線粒體——代替線粒體，這些生物具有氫化酶體（hydrogenosome），紡錘剩體（mitosome）或其它未識(shí)別的細(xì)胞器。共同特點(diǎn)是都沒(méi)有線粒體?；蚍治霰砻鳎@些生物的細(xì)胞核中有線粒體的基因標(biāo)志。這些生物都是寄生生活的，能夠從其它來(lái)源獲得ATP。源真核生物的一個(gè)例子是毛滴蟲(chóng)（Trichomonas Vaginalis），是常見(jiàn)的尿路感染，通過(guò)性接觸傳播。

單系起源

古蟲(chóng)界是否為單系群（monophyletic group），仍然缺乏基因證據(jù)。可能是幾個(gè)并行的進(jìn)化分支。^[6]

某些古蟲(chóng)界的物種被認(rèn)為是非常原始的真核生物，位于進(jìn)化樹(shù)的底部。這示意古蟲(chóng)界可能是多系群，包含著其它原生生物的祖先。但這也可能是由于長(zhǎng)枝吸引（long branch attraction），這已經(jīng)在微孢子蟲(chóng)（microsporidia）中有過(guò)前例。

馬拉維單胞蟲(chóng)

除上述類群外馬拉維單胞蟲(chóng)綱（Malawimonas）由于其分子系統(tǒng)學(xué)證據(jù)被認(rèn)為可能是古蟲(chóng)中的一種，但其在其中的系統(tǒng)位置待定。^[7]

參見(jiàn)

• 源真核生物界
• 真核生物
• 原生生物

參考文獻(xiàn)

1. ↑ Simpson, Ag; Inagaki, Y; Roger, Aj. Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of "primitive" eukaryotes (Free full text). Molecular Biology and Evolution. Mar 2006, 23 (3): 615–25. doi:10.1093/molbev/msj068. PMID 16308337 
2. ↑ ^{2.0 2.1} Hampl V, Hug L, Leigh JW, et al. [http//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2656170/ Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups"]. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. March 2009, 106 (10): 3859–64. doi:10.1073/pnas.0807880106. PMID 19237557. PMC 2656170. 
3. ↑ Simpson AG. Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota). Int. J. Syst. Evol. Microbiol.. November 2003, 53 (Pt 6): 1759–77. doi:10.1099/ijs.0.02578-0. PMID 14657103. 
4. ↑ Cavalier-Smith T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.. March 2002, 52 (Pt 2): 297–354. PMID 11931142. 
5. ↑ Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Henner Brinkmann, Gertraud Burger, Andrew J. Roger, Michael W. Gray, Hervé Philippe, and B. Franz Lang. Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans. Curr. Biol.. August 2007, 17 (16): 1420–1425. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961. 
6. ↑ Laura Wegener Parfrey, Erika Barbero, Elyse Lasser, Micah Dunthorn, Debashish Bhattacharya, David J Patterson, and Laura A Katz. [http//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1713255/ Evaluating Support for the Current Classification of Eukaryotic Diversity]. PLoS Genet.. December 2006, 2 (12): e220. doi:10.1371/journal.pgen.0020220. PMID 17194223. PMC 1713255. 
7. ↑ Cavalier-Smith T. The excavate protozoan phyla Metamonada Grassé emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) and Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): their evolutionary affinities and new higher taxa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.. November 2003, 53 (Pt 6): 1741–58. doi:10.1099/ijs.0.02548-0. PMID 14657102. 

外部鏈接

• Tree of Life Eukaryotes
• Tree of Life: Jakobida
• Tree of Life: Fornicata

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參考來(lái)源

• 維基百科-古蟲(chóng)界

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